創薬研究において、化学構造にバリエーションがある活性化合物を持つことは重要であり、

本講演では、既存の活性化合物の構造情報から骨格変換を通じて

多様な構造を持つ新たな活性化合物候補を提案するサービス「drug2drugs®」を紹介する。

まず、本サービスの核となる「アミノ酸マッピング(AAM)記述子」について、

化合物活性の高速・高精度推定を可能にする原理を、具体的な事例とともに解説する。

次に、本サービスを、ポリペプチドを出発点に非ペプチドの低分子の活性化合物へと骨格変換する課題に活用した事例について触れる。

ここでは、AAM記述子とタンパク質構造を用いた結合エネルギー計算手法を組み合わせることで、

ポリペプチドの重要部位を低分子の活性化合物に変換し、

その上で、標的タンパク質との新たな相互作用を取り込むことで、本低分子化合物の活性を効率的に改善できることを示す。

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